1、农业合作社是建国初期为恢复生产，增强农民抵御自然灾害的能力而成立的农村生产互助组织。是人民公社的较低级形式，在当时人力物力有限的情况下产生。后来农业合作社的活动不断扩大，才于1958年发展成人民公社。
2、农业企业是指通过种植、养殖、采集、渔猎等生产经营而取得产品的盈利性经济组织。有广义与狭义之分。前者包括从事农作物栽培业、林业、畜牧业、渔业和副业等生产经营活动的企业；后者仅指种植业，或指从事作物栽培的企业。我国现阶段农业企业，主要是国营农场和集体所有制农业。国营农场以全民所有制为主体，具有多种经济形式。在其内部，依据因地制宜、自愿互利的原则，实行国营、集体经营，或家庭、职工个人经营，或联合经营。

温馨提示：以上解释仅供参考。
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区别如下：

一、与公司以营利为目的，合作社是一种互助性的经济组织

合作社是在农村家庭承包经营基础上，同类农产品的生产经营者或者同类农业生产经营服务的提供者、利用者、自愿联合、民主管理的互助性经济组织。其目的在于通过为成员提供购销、加工、运输、储藏、技术、信息等方面的服务，使成员联合进入市场，形成聚合的规模经济，以节省交易费用、增强市场竞争力、提高经济效率、增加成员收入。因此，合作社的主要目的在于为成员提供服务，尽管在提供服务过程中合作社也可能会有盈利。作为重要的市场主体之一，合作社对外也展开经营，也需要营利，但这并非是其主要目的，并且对外经营和营利服从于为成员提供服务。

二、合作社与实业公司相比，成员制度不高

尽管股东加入公司、成员加入合作社都是一种日夏养花网自愿的行为，但是，合作社的所有者与使用者具有同一性，即成员加入合作社是为了利用组织提供服务；而公司制度下的所有者和使用者是分离的，股东并不是需要利用公司的服务。如农业生产资料购买合作社的社员，是那些想从通过合作社购买到优质、廉价的农资的农户；而像农资公司的股东是那些要经销农资的人，他们自身并不想使用农资。再如农产品销售合作社的所有者主体，是那些提供农产品的农户，而农产品销售公司的股东并不一定是自我提供农产品。

三、办合作社的门槛比办公司要低

《农民专业合作社法》对于合作社的出资问题有非常宽松的规定，农民入合作社可以出资也可不出资。但是实业公司则有最低注册资本的要求。

四、公司股东不能抽回出资，合作社实行“退社自由”的原则

实业公司法不允许股东在公司成立后抽回出资，只能向其他人转让公司的股份。而合作社实行“退社自由”的原则，但却不能将出资额和成员资格转让他人。

合作社是几家农户具有相同的农业项目联合起来做的一个小组织，公司和其他行业的公司性质都一样

农民专业合作社是国家针对农民和农业产业发展而专门设立的一部法律,它有严格的农民成员比例限制,农民成员必须达到80%http://www.rixia.cc,其它专业合作社则无此限制,也不能享受《农民专业合作社法》规定的有关优惠政策。

　　是有区别的。
　　1、成立目的不同。农民专业合作社以服务成员为宗旨，谋求全体成员的共同利益，不以营利为目的；而企业则追求企业利益的最大化。
2、主体不同。农民专业合作社成员以农民为主体；而公司、合伙企业、个人独资企业没有对出资人的身份做特别规定。
3、服务对象不同。农民专业合作社以成员为主要服务对象，提供产前、产中、产后的技术、信息、生产资料购买和农产品的销售、加工、运输、贮藏等服务。而企业则一般没有所谓的内部服务，服务对象主要是面对市场大众。
4、财产关系不同。农民专业合作社的财产按份额量化到个人，记载在成员账户中。而股份制的企业，股东的出资构成企业的财产，不将企业的财产按份额量化在股东名下。
5、退出机制对法人资产的影响不同。农民专业合作社成员加入自愿、退出自由。成员退出时，可以带走自己加入时的出资和记载在其账户内的由公积金形成的财产份额。而加入企业的股东一般只能以转让股份的形式退出（减资有特别规定，如企业法人要清偿债务或提供担保），而如果没有人愿http://www.rixia.cc意接受你所转让的股份，那么你就根本没法退出，这种退出一般并不带来企业法人资产的减少。
6、地位不同。农民专业合作社成员地位平等，实行民主管http://www.rixia.cc理。而股份制企业则是以股东所持有的股份为决策的基石。
7、分配方式不同。农民专业合作社的盈余主要按成员与农民专业合作社的交易量比例返还，盈余分配的基础是成员对合作社提供服务的利用程度，即“按惠顾额返还盈余”。而一般企业的利润则“按股分红”。

没有区别，现行的农民专业合作社法是2007年7月1日开始实施的，与合作社发展的多种形式已经不相适应，为解决这一问题，中央一号文件已经使用农民合作社一词。农民专业合作社法也在征求修改之中。

是大与小的区别，农民合作社的外延要比农民专业合作社大得多。

可能一种说法比较老旧。

　　农民专业合作社简称农合社，是以农村家庭承包经营为基础，通过提供农产品的销售、加工、运输、贮藏以及与农业生产经营有关的技术、信息等服务来实现成员互助目的的组织，从成立开始就具有经济互助性。拥有一定组织架构，成员享有一定权利，同时负有一定责任。
　　合作社
　　合作社作为劳动群众自愿联合起来进行合作生产、合作经营所建立的一种合作组织形式在中国已有百年历史。中国历史上第一个合作社产生于1918年，是由北大倡导合作思想的胡钧教授及其学生们共同组织创办的“北大消费公社”。1922年9月毛泽东在安源创办的“路矿工人消费合作社”是中国共产党领导下的第一个合作社。
　　新中国成立后，我国普遍实行了合作化道路，在城镇和乡村组织成立了供销合作社、消费合作社、信用合作社、生产合作社和运输合作社。到1955年，农业、商业或手工业的合作化都有了比较快的发展。但是由于后来中央的路线转到了全面实施社会主义改造，在长达20年的人民公社体制下，受行政性计划经济的影响，使农民合作经济组织变质，越来越不适应经济发展的要求。
　　改革开放以后，农村实行家庭联产承包责任制，极大地调动了广大农民的生产积极性，在一定时期内，促进了农村生产力的发展，极大地改善了农民的生活。为顺应农业机械化、现代化的发展趋势，农民合作社这个新中国成立初曾炙手可热的历史名词重新焕发出新的光彩，因其能帮助农民克服个体经济的局限而受到农民的欢迎，成为当下农村一种新形式的互助性经济组织。
　　随着2006年《中华人民共和国专业合作社法》的正式颁布，农民专业合作社(以下简称农合社)进入了黄金发展期。公开资料显示，截至2013年11月底，全国依法登记的专业合作、股份合作等农合社超过95万家，是2007年底的近40倍。
　　农合社与农信社
　　农村信用合作社指经中国人民银行批准设立、由社员入股组成、实行民主管理、主要为社员提供金融服务的农村合作金融机构。在部分农村地区，农民专业合作社存在利用高额回报吸收资金现象，农合社给股民开具的“股金单”与信用社储蓄存单相似，上面有户名、身份证号、金额、入股时间、到期时间和年收益率，并且一般盖有专业合作社业务公章。办事大厅与信用社装修风格相似，有金属护栏。这些极具迷惑性的做法使得部分农民很难分辨农合社与农信社的区别。
　　根据《中华人民共和国农民专业合作社法》规定，农民专业合作社以其成员为主要服务对象，提供农业生产资料的购买，农产品的销售、加工、运输、贮藏以及与农业生产经营有关的技术信息服务。吸收农民存款的农业合作，是属于超范围经营。本来是服务于农民，提高农民收入的好政策，却被一些不良用心的人利用，成了非法吸取公众存款的工具。

这个有点复杂。个人理解说：农民专业合作社一般指现代农村中的合作经济组织；而农业生产合作社是共和国成立之后在农村实行的公有制结合集体所有制产生的合作经济组织，其中土地无偿转为集体，大的生产资料是国家的，一些小的生产资料还是属于个人；但农民专业合作社是在个人自愿的前提下加入的，所有生产资料比如土地，机械都可以用入股的形式体现出来，基本不存在集体和国家的，除非是村集体领办的合作社，。主观点就这样想：农业生产合作社是计划经济时代政府领办的东西，是由上而下的；而农民专业合作社是改革开放后，在家庭承包责任制为基础上出现的农村合作组织，是自下而上的。