一、细胞形态不同

1、细菌为很多圆球状或小杆状；

2、放线菌，单细胞，呈分枝丝状；

3、霉菌菌丝有隔，分生孢子；显微镜下青霉扫帚状排列的分生孢子小梗，曲霉膨大的分生孢子头（顶囊），分生孢子梗直立于菌丝独特厚壁的足细胞上。

4、酵母菌，是较细菌的单细胞个体明显大得多，形态有卵圆形、球形、腊肠形、柠檬形或藕节形。

二、细胞结构不同

1、细菌： 原核细胞 ，没有细胞核；

2、放线菌：日夏养花网 原核细胞 ，没有细胞核；

3、霉菌： 真核细胞，有细胞核；

4、酵母菌： 真核细胞，有细胞核、细胞壁WsUcuyQr、细胞膜、细胞质、液泡、线粒体等；

三、菌落特征（群体形态）不同

1、细菌菌落凝胶状、表面较光滑、湿润，与培养基结合不紧密，易挑取，正反颜色一致；

2、放线菌菌落固体培养基上呈辐射状生长，致密、坚硬、多皱、不易用针挑起，不透明。孢子成熟后，表面粉末状,干燥，常有土腥味；

3、霉菌菌落较大,由菌丝组成疏松的绒毛状、絮状或蜘蛛网状，有的无固定大小，延至整个培养基，产色素，菌落有颜色；

4、酵母菌菌落与细菌菌落相似，但比细菌大而厚，不透明，表面光滑、湿润、粘稠，易用针挑起，多呈乳白色；

四、繁殖方式不同

1、细菌：二分裂
方式；

2、放线菌：孢子生殖；

3、霉菌：孢子生殖；

4、酵母菌：无性繁殖：出芽繁殖；有性繁殖
，通过接合形成子囊及子囊孢子。

五、种属不同

1、细菌是原核生物；

2、放线菌属于原核生物；

3、霉菌都属于真菌；

4、酵母菌属于真菌。

参考资料：

百度百科——细菌

百度百科——放线菌

百度百科——霉菌

百度百科——酵母菌

在显微镜下细菌，放线菌，酵母菌，霉菌主要差别如下：

细菌：为细而短的单细胞微生物，主要形态有：球、杆、螺旋状等。部分杆菌可形成芽孢。

放线菌：存在分枝丝状体和菌丝体，有孢子丝和孢子。 

酵母菌：单细胞，菌体呈圆球、卵形或椭圆形，少数呈柠檬形、尖形等。菌体比细菌大几倍到几十倍。

霉菌：菌丝和孢子的宽度通常比细菌和放线菌粗得多，常是细菌菌体宽度的几倍到几十倍，在低倍镜下即可看到，并还可看到孢子囊梗、囊轴、孢子囊、包囊孢子等。