1、细胞伸长和组织分化

生长素（吲哚乙酸）和硼之间有明显的相互作用。在根系中硼抑制吲哚乙酸氧化酶活性。在吲哚乙酸的刺激作用下，根伸长正常。绿色植物中吲哚乙酸只有在维管束植物中形成，它参与木质部导管的分化。因此一般对硼的需求也仅限于维管束植物。却硼植物木质部分消弱。茎形成层细胞分裂加强，形成层细胞增生。

2、酶代谢和木质形成

酚类化合物积累抑制吲哚乙酸氧化酶的活性。硼能与酚类化合物络合，克服酚类化合物对吲哚乙酸氧化酶的抑制作用。在木质素形成和木质部导管分化过程中，硼对羟基化酶酚类化合物酶的活性起抑制作用。

3、碳水化合物运输和蛋白质代谢

硼在碳水化合物代谢中有两方面作用：细胞壁物质的形成和糖运输。硼能促进葡萄糖－1-磷酸的循环和糖的转化。硼与钙共同起“细胞间胶合物”的作用。硼影响RNA,尤其是尿嘧啶的合成。

缺硼植物新叶蛋白质含量低，这仅限于细胞质，而叶绿体蛋白质含量不受影响，因此缺硼植物失绿并不普遍。硼能加强作物光合作用，促进碳水化合物的形成。当作物硼素不足时，就会造成叶片内糖和淀粉等碳水化合物的大量积累，不能运送到种子和其他部位，从而影响作物产量。

4、根生长发育

硼能促进豆科作物根中维管束的正常发育，促使根瘤菌得到碳水化合物的充足供应，从而增强了豆科作物的固氮能力，提高蛋白质的含量，增加麻类作物的纤维含量，并改善它的品质。

硼与醇类、糖类以及其他化合物能形成过氧化物，从而改善作物根部氧气的供应。特别是在缺氧的情况下，施用硼肥可以促进作物根系发育。所以，块根、块茎作物如甜菜、土豆、萝卜等，施用硼肥效果较好。

5、作物抗逆性

硼能增强作物的抗旱、抗病能力。硼在作物体内有控制水分在作用，能提高向日葵、荞麦等作物原生质的粘滞性，增强胶体结合水的能力。施用硼能促进维生素C的形成，维生素C的增加可以增加作物的抗逆性。