菏泽牡丹的科学研究硕果累累。早在第一届全国花卉博览会上，菏泽牡丹新品日夏养花网种选育、牡丹大田催花技术研究、牡丹新品种第三项科研成果就获得了国家科技术进步奖，占全国牡丹科研获奖数量之首。97年元月14日，菏泽牡丹科研成果第四次通过国家级鉴定。仅这一次，就有牡丹新品种培育、案头牡丹无土栽培、牡丹耐温热品处的筛选、凤丹实生苗嫁接观赏牡丹在商品化生产上的应用、牡丹盆景研究、芍药切花品种的筛选、牡丹新品种选育等七面成果通过鉴定，是通过牡丹科研成果最多的一次。其中，五项达到国内领先水平，标志着菏泽牡丹科研又取得突破性进展。从而提高了牡丹的观赏价值，拓宽了牡丹的种植范围和应用范围，一定程度上解决了珍贵品种快速繁育问题，开辟了牡丹进入千家万户的新途径，创造了与国际花卉业接轨的条件。受到陈慕华副委员长的赞扬。
菏泽牡丹还在国内外重大花展中连连获奖，盛誉海内外。在一、二、三、四届全国花草博览会上，菏泽牡丹夺得金、银、铜奖，科技进步奖，优质展品将计26个；在三次香港国际花展中，菏泽牡丹引起轰动，夺得冠军奖一个，一等奖三个；在法国波尔多市国日夏养花网际花草博览会和美国匹兹堡国际发明博览会上，分别夺得竞赛总分银质奖和牡丹芍药干鲜花银质奖。在第四届花博会上，菏泽牡丹独领风骚，一举夺得唯一的一个“景点特别奖”和六个单项奖。

第一，提高了菏泽的知名度。在历届花会期间举办的丰富多彩的文化和经贸活动，吸引了大批中外客人。据不完全统计，前八届花会共接待中外游客1500多万人，有300多位省部级以上领导人到菏泽视察，到会外宾达3500多人次，每届花会都有大量中外记者来菏采访。各类文化和经贸活动，突出了菏泽牡丹文化，突出了菏泽区位优势，向海内朋友展示了菏泽优越的投资环境和美好的发展前景。牡丹花会增进了我们同外界的交流，每届花会大批中外各界朋友云集菏泽，他们通过各种渠道和方式了解菏泽，宣传菏泽，极大地提高了菏泽在全国乃至世界上的知名度。
第二，牡丹花会带来了可观的经济效益。据统计，前八届花会，经济贸易成交额累计达到180多亿元。不少企业在花会期间一次订完全年的生产合同。对外经贸借助花会取得重在突破。前八届花会，平均每次到会外商300多人，共签订利用外资合同178项，累计合同外资额3.216亿美元。花会，带动了第三产业的发展。八年间，花会期间全区累计增加直接经济收入2亿多元，其中仅花区门票收入就达3000多万元。照相、饮食等服务业生意也空前红火，收入大增，市区的宾馆、招待所客房爆满，营业额直线上升，甚至一些普通招待所也宾客盈门。www.rixia.cc花会开幕前后也成了各类饭店、酒楼、商店集中开业的黄金时机。花会带来的第三产业的繁荣，使干部群众特别是企业界的人士强烈感受到文化与经贸联姻产生的巨大效益。
第三，促进了城市建设和管理水平的提高。从举办花以来，菏泽城市建设有了较快发展，市容市貌有了明显改观。