一、分类单元
　　植物病原原核生物并不独立于原核生物之外，其命名原则、分类方法、分类单元和分类系统与原核生物相同。界、门、纲、目、科、属、种。
　　细菌属的特征：形态特征和培养性状、生理生化性状、遗传性状。
　　种（species）的概念：种是许多具有共同特征的菌系组成的群体，通常这些菌系与其它菌系有很大的区别。基因种——细菌分类学家，分类种——植物病理学家。
　　亚种（subspecies）：指在种下类群中在培养特性、生理生化和遗传学等性状有一定的差异的群体。
　　菌系（strain）：是由分离获得的纯培养物单个菌落繁衍的后代组成。
　　模式菌系（type strain）：是种的命名菌系，由它以及和它相似的其它菌系组成种。由于细菌的种的概念包含人为的主观判断，因此，细菌种的表型和遗传特性上存在明显的多样性。目前认为根据遗传的相关性来定种更为客观。
　　致病变种（pathovar，pv.）：在细菌种下以寄主范围和致病性为差异来划分的组群。
　　生化变种（biovar）：是种内的菌株，按生理生化性状的差异来划分的组群，不考虑致病性等其他性状的异同。
　　二、 命名
　　植物病原细菌学名采用双名法，以拉丁文表示。
　　细菌的学名由国际细菌命名法规所规定，法规的最新版本发表了《核准的细菌名录》（Approved lists of Bacterial Names），名录包括经过国际系统细菌学委员会核准生效的所有细菌的科学名称，从1980年1月1日起始用。
　　植物病原细菌的某些种之间除了致病性外，难于用生理生化特性加以区别，则为同物异名，因此未能列入《核准的细菌名录》。
　　为了保留这些细菌的分类地位，植物病理学家采用致病变种作为这些同物异名的分类单元，1980年编制了《植物病原细菌致病变种名录》。
　　三、分类系统
　　《伯杰细菌鉴定手册》（Berge’s Manual of Determinative Bacteriololy）中的细菌分类体系被微生物学家普遍采用。1923年，第一版问世，到1994年已出版9版。
　　根据《伯杰细菌鉴定手册》（1994）和近年来《国际系统细菌学杂志》（www.rixia.ccInternational Journal of Systematic Bateriology, IJSB）报道的新属新种资料，原核生物界通常分为4个门，7个纲，35个组群。
　　▲薄壁菌门（Phylum Gracilicutes）：有壁较薄，厚度为8~10nm，肽聚糖日夏养花网含量约5~10%，G-。包括大多数植物病原细菌。
　　▲厚壁菌门（Phylum Firmicutes）：有壁较厚，厚度为50~80nm，富含磷壁酸和肽聚糖，G+。包括棒形杆菌属、芽孢菌属和链霉菌属。
　　▲软壁菌门（Phylum Tenericutes）：菌体无壁，外层为三层单位膜所包被，厚度约5nm。包括类菌原体。
　　▲疵壁菌门（Phylum Mendosicutes）：这是一类没有进化的原细菌或古细菌，细胞壁中无胞壁酸和肽聚糖。包括产甲烷细菌和高盐细菌。

常见植物病原细菌属及其主要特征如下：
(1) 假单胞菌属。菌体短杆状或略弯，鞭毛1~4根或多根，极生。革兰氏染色反应 阴性，严格好气性。培养基上形成的菌落为灰白色,有的能产生荧光色素。危害植物引 起叶斑、坏死及茎秆溃疬等症状。
(2) 黄单胞菌属。菌体短秆状，有一根极鞭，革兰氏染色反应阴性，严格好气性。培 日夏养花网养基上形成蜜黄色菌落。危害植物主要引起叶斑、叶枯，少数引起萎蔫等症状。如水稻 白叶枯病、甘蓝黑腐病。
(3) 土壤杆菌属。菌体短杆状，鞭毛1~6根，周生或侧生。革兰氏染色反应阴性, 好气性。培养基上形成黏性的灰白色至白色菌落。常引起木本植物的瘤肿和发根等畸 形症状。如果树根癌病。
(4) 欧文氏菌属。菌体短杆状，除一个种无鞭毛外，都有多根周生鞭毛。革兰氏染 色反应阴性，兼性好气性。培养基上菌落灰白色。危害植物后多引起软腐，少数引起枯 死和萎蔫。如十字花科蔬菜软腐病等。
(5) 棍状杆菌属。菌体短杆状至不规则杆状，无鞭毛,革兰氏染色反应阳性，好气 性。培养基上菌落多为灰白色。危害植物后引起萎蔫、溃疡等症状。如马铃薯www.rixia.cc环腐病等。

由微生物引起的植物病害具有重要的生态学及重大的经济意义。能寄生于植物的病毒、细菌、真菌和原生动物都属于植物病原微生物。在轻微条件下它们只引起植物生长的失调并降低其在生态环境中的生活和竞争能力；严重时则会导致植物死亡、大幅度减产和饥荒。病原微生物与植物的相互关系有一定的专一性。不同病原菌的寄主范围宽窄不同，有些病原菌只危害一种或少数几种植物，日夏养花网另一些病原菌的专一性较低，它们常能寄生于多种不同的植物。有些病原菌除了寄生以外，在没有适合的寄主时，还能营腐生生活，它们属于兼性寄生的类群。在植物体内大量发展的病原菌通过各种途径干扰植物的正常功能并引起病害的典型症状。例如，植物叶组织坏死造成叶斑；果胶酶和纤维素酶可使植物组织和细胞解体造成溃疡和腐烂；气孔或输导组织被病菌侵染后可导致萎蔫和枯萎；叶绿素合成代谢的破坏则造成植株缺绿；病原菌产生的吲哚乙酸等生长素类物质可使局部组织细胞过度增生而产生畸形、树瘿等特殊形态。植物一旦受到病原微生物的危害之后常常会给某些条件致病菌造成侵染的机会，两类微生物的双重侵染又进一步加重了对植物的损害。植物病害对农业、林业及畜牧业的发展造成了重大的威胁，严重时甚至会影响到一种作物在某一特定地区种植的可能性，在病害高发区种植的作物产量极低甚至会颗粒无收。
（1）植物病原真菌（2）植物的细菌性病害（3）植物的病毒性病害