在ICTV公布的病毒分类第七次报告中，共有909个植物病毒（包括594个确定种和315个暂定种），分别归属于日夏养花网15个科、72个属，比第六次报告中的11个科、47个属有了较大增加。根据最新的病毒分类系统可将植物病毒划分为5个大类群：日夏养花网

（1）单链DNA（ssDNA）病毒类群日夏养花网

包括双生病毒科玉米线条病毒属、曲顶病毒属、菜豆金色花叶病毒属的102个病毒，矮缩病毒属的5个病毒。

（2）双链DNA（dsDNA）病毒类群

包括花椰菜花叶病毒科花椰菜花叶病毒属、碧冬茄脉明病毒属、大豆褪绿斑驳病毒属、木薯脉花叶病毒属、杆状DNA病毒属和水稻东格鲁杆状病毒属的34个病毒。

（3）双链RNA（dsRNA）病毒类群

包括呼肠孤病毒科植物呼肠孤病毒属、斐济病毒属和水稻病毒属的13个病毒，双分病毒科隐潜病毒属、隐潜病毒属的31个病毒和日夏养花网巨脉病毒属的4个病毒。

（4）单链负义RNA（—ssRNA）病毒类群

包括弹状病毒科内未归入属的58个病毒以及细胞核弹状病毒属和细胞质弹状病毒属的15个病毒，布尼亚病毒科番茄斑萎病毒属的13个病毒，纤细病毒属的11个病毒和蛇形病毒属的3个病毒。

（5）单链正义RNA（+ssRNA）病毒类群

包括伴生病毒科、页豆花叶病毒科、马铃薯Y病毒科、黄症病毒科、番茄丛矮病毒科、雀麦花叶病毒科、长线形病毒科以及烟草花叶病毒属等另外20个未归入科病毒属的共612个病毒。

此外，归属在伪病毒科中7个以植物为寄主的单链RNA逆转录因子，以及转座病毒科中1个单链RNA逆转录转座子还没有更详细的研究资料。

植物病毒的科和属，见下图。

植物病毒的科属

在病毒的研究过程中，还相继发现了一些与病毒相似、但个体更小、特性稍有差别的病毒类似物。其中一些要依赖其他病毒才能存在的小病毒或核酸，称为卫星（satellite），它们依赖的病毒称为辅助病毒（helper virus）。它们的核酸与辅助病毒很少有同源性，且影响辅助病毒的增殖；其中自身能编码衣壳蛋白的称为卫星病毒，不能编码衣壳蛋白的日夏养花网称为卫星核酸。由于植物病毒的卫星核酸都是RNA，故称为卫星RNA（satellite RNA，sRNA）。另外一些无衣壳蛋白、单链环状的RNA，内部具有高度配对的双链结构，能单独侵染和增殖复制，此RNA称为类病毒（viroid）；含有线状和环状两种分子，长度为350个核苷酸，依赖于辅助病毒才能侵染和增殖复制，此RNA的称为拟病毒（virusoid）；没有核酸只有蛋白质的侵染因子称为朊病毒（prion）。为了分类上的方便，将这些病毒都归入亚病毒（subviruses），而由核蛋白体构成的病毒则称为真病毒（euviruses）。