（1）两栖类或两栖动物  （2）爬行   （3）B   （4）自然选择

（1）动物类群1是哺乳类，其繁殖方式最主要的特征是胎生哺乳．植物类群2被子植物，种子有果皮包被；植物类群3是裸子植物，能产生种子，用种子繁殖后代，适应环境的能力强，适于生活在干旱的陆地上，植物类群4是蕨类植物，不结种子，用孢子繁殖后代，属于孢子植物，孢子的生命力较低，适应能力较差，因此蕨类植物比种子植物低等．故植物类群3在繁殖方式上比植物类群4高等的主要表现是用种子繁殖．
（2）在分类上，生物进化树的两大主干代表的分类等级是植物界和动物界．因此在分类上，该进化树的两大主干代表的分类等级是界日夏养花网．2是最高级的植物类群，被子植物．在被子植物中，花、果实和种子往往作为分类的重要依据，因为花、果实和种子等生殖器官比根、茎、叶等营养器官在植物一生中出现得晚，生存的时间比较短，受环境的影响比较小，形态结构也比较稳定．因此往往把花、果实、种子作为最重要的依据．
（3）从生物进化树上，可以看出与单细胞动物亲缘关系最近的生物类群是肠腔动物，从图中可以看出生物进化的总体趋势是从简单到复杂，从低等到高等，从水生到陆生．
故答案为：
（1）胎生哺乳；用种子繁殖；（2）界；花、果实、种子；
（3）腔肠动物；从简单到复杂、从低等到高等、从水生到陆生．

（1）、动物进化历程：原始单细胞动物→无脊椎动物→脊椎动物，脊椎动物进化过程：原始鱼类→原始两栖类→原始爬行类→原始的鸟类、哺乳类．因此图中的“□”代表的动物是两栖类．
（2）、1860年，在德国巴伐利亚省的石灰岩层中，发现了第一个始祖鸟化石．始祖鸟的身体大小如乌鸦，它保留了爬行类的许多特征，例如嘴里有牙齿，而不是形成现代鸟类那样的角质喙；指端有爪等；但是另一方面，始祖鸟又具有鸟类的一些特征，如已经具有羽毛，在一些骨骼形态上也表现出一些鸟类特征或过渡特征，如它的第三掌骨已经与腕骨愈合，总之，它的身体结构既和爬行动物有相似之处，又和鸟类有相同之处，根据以上特征，科学家认为始祖鸟是由爬行类进化到鸟类的一个过渡类型．
（3）、鱼适于在水中生活的特点：①鱼的体形成梭形，体表有粘滑的感觉，可以减少水的阻力；②体表有鳞片具有保护作用；③呼吸器官是鳃，吸收水中的溶解氧④用鳍游泳等．⑤鱼体内有侧线可以感知水流，测定方向为鱼的感觉器官．而鱼的背部有脊柱与水中生活无直接关系．故选B．
（4）、地球上多样的生物都是由古代的生物进化而来的．达尔文的生物进化学说认为生物进化是自然选择的结果．
故答案为：（1）两栖类
（2）爬行类
（3）B
（4）自然选择