A、生长素的化学本质是吲哚乙酸，不是蛋白质，A错误；
B、由题目所述可知，在促进植物生长方面，生长素和赤霉素具有协同作用，因此在图二中X应表示的是抑制作用，B错误；
C、色氨酸是植物细胞在代谢过程中产生的，不是植物从根部吸收的，C错误；
D、从图中可以看到，单独加IAA的曲线比单独加GA的曲线高很多，说明IAA的促进效应较GA明显．IAA、GA都加的曲线最日夏养花网高，说明这种激素同时存在时，具明显的增效作用，D正确；
故选：D

A、从图一曲线变化趋势可知，生长素和赤霉素对切段的伸长都有促进作用，而且生长素（IAA）的促进效应较赤霉素（GA）明显，故A错误；
B、两种激素同时存在时，具有明显增效作用，说明IAA和GA具有协同作用，故B正确；
C、从图二所示信息可知，赤霉素通过促进生长素的合成，日夏养花网抑制生长素的分解，但只有生长素直接促进细胞伸长，故C错误；
D、赤霉素通过促进色氨酸合成生长素，进而促进生长，故D错误．
故选：B．

（1）单独加入IAA和GA或同时加入IAA和GA茎的平均伸长量都高于对照组，且IAA的促进效应较GA明显和联合使用IAA和GA的伸长量最大，所以可以得出的结论有IAA和GA均具有促进植物生长的作用，但IAA的促进效应较GA明显；IAA和GA具有协同作用（或两种激素同时存在时，具有明显增效作用）．
（2）预实验的目的是为正式实验摸索条件（或确定正式实验的浓度范围）检验实验设计的科学性和可行性．
（3）据图二分析，①X表示赤霉素对生长素的分解具有抑制作用，从图中可以看出，赤霉素主要是通过提高生长素的含量来促进茎段伸长的．
②图中，赤霉素与生长素表现出激素间的协同作用．
③题干所述病症可以使用外源赤霉素的方法使植株明显增高．但常表现出叶色偏黄，这是生长太快导致叶绿素浓度降低引起的，可通过增施氮肥解决．
故答案为：
（1）①IAA和GA均具有促进植物生长的作用，但IAA的促进效应较GA明显
②IAA和GA具有协同作用（或两种激素同时存在时，具有明显增效作用）
（2）为正式实验摸索条件（或确定正式实验的浓度范围）检验实验设计的科学性和可行性
（3）①抑制 生长素
②协同作用
③赤霉素 氮