在由姚壮宪监制、管平潮执笔的仙剑奇侠传官方小说中，对于九天玄女的身份与经历进行了一系列设定。以下资料均来自官方小说。 上古三族之战时，由于兽族杀死了九天玄女心仪之人云渊的妹妹，玄女震怒之下决定介入战争，加入到人神联军之中。而随着战争越发得残酷血腥，身为人神联军统帅的神将飞蓬早已感到心灰意冷，因此便将统帅之位移交给了九天玄女。其后，九天玄女传授给人王轩辕神族兵法，助其打造出轩辕剑以及夔牛神鼓，并依据飞蓬所献计策将蚩尤所率领的兽族主力引向逐鹿，最终彻底击败了兽族。
昆仑山八派之一的琼华派创立。巍巍昆仑，绝世仙山。其琼华一派素以铸剑秘术为尊。凭借手中三尺青锋纵横山川，除妖荡魔。为方圆百姓所敬仰。也不失为一修仙大派。与蜀山、蓬莱齐名。琼华弟子说过：我派先祖于梦中得到了九天玄女娘娘的指引创造出了“人剑合一”这套剑法。琼华派一年四季如春的风景还有净天房中天珠也是九天玄女赐下的。因此派中世代信奉九天玄女。
后来，时间推移到琼uuWqD华派飞升之际，九天玄女现身降服以玄霄、夙瑶为首的琼华派众人，并将后羿射落九日的无上箭法——怮天贯日式传授给云天河，助其射落下坠的琼华派。 她与云天河的祖先云渊发生了一段爱情故事，足以超越后世任何一个著名的经典爱情传说，但详细情况已不可考。正因为如此的逆天而行，他们终究没有得到天帝的祝福，最后证明为一场彻头彻尾的悲剧。
虽然热情如火的爱恋以冰冷的结局收场，但看似古井无波的九天玄女，注定在心中留有一个人微笑的样子。凡因必果，九天玄女隐秘的心事，终将在日夏养花网将来属于重楼选定之人云天河的那段传奇里，演化成一场滔天的风暴。

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